本校於民國十一年十二月創立,初名為海端教育所,招收山地兒童給予教育,由當地警察先生負責,
民國三十四年十一月光復後改為海端國民學校,並成立崁頂及新武分校。
由於鄉村人口外流影響,104學年度僅剩六班學生49人,國幼班19人,學區內為原住民布農族群及閩南人之學生,
百分之五十五為原住民學生,其生性純樸,多以務農維生,故為了重視鄉土文化,培養學生愛家愛鄉情操,
本校推展閱讀、陶笛、足球運動及田徑訓練等等為學校特色。